Settet brukes til in vitro kvalitativ påvisning av ORF1ab/N/S-genene til det nye coronavirus 2019-nCoV i luftveisprøver inkludert orofaryngeale vattpinner, nasofaryngeal vattpinne, sputum og utføre mutasjonstyping på HV69-70 del samtidig.Som rapportert i GISAID-databasen, inkluderer mer enn 95 % rapporterte Omicron-variantsekvenser en sletting i HV69-70, som kan forårsake en S-genmålsvikt (SGTF) i PCR-analyser.SGTF kan brukes som en proxy-markør for å screene for Omicron.
Primersett og FAM-merket probe er designet for spesifikk påvisning av ORF-lab-genet av 2019-nCoV, VIC-merket probe for N-genet av 2019-nCoV, ROX-merket probe for S-genet HV69-70 del mutasjon av 2019-nCoV.Humant RNase P-gen ekstrahert samtidig med testprøven gir en intern kontroll for å validere nukleisk ekstraksjonsprosedyre og reagensintegritet.Probe rettet mot humant RNase P-gen er merket med CY5.
Sanntids PCR-system: Aehealth Diagenex AL, ABI 7500, ViiATM 7, Quant Studio 7 flex.Roche Lightcycler 480, Agilent Mx3000P/3005P, Rotor-GeneTM6000/0.Bio-Rad CEX96 TouchTM SLAN-96S.SLAN-96P, MA 6000;